CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs_0601/565.mrc Output diagnostic file name Micrographs_0601/565.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 512 35.0 3.0 10000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs_0601/565.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2414.000 8384.000 Mean, RMS : 4538.579 226.0961 TITLE 1: emi2mrc: 565.emi Mon Jan 06 18:57:54 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 21990, Spot 4, Int 55.04%, Obj 88.06%, Dif 73.67% TITLE 3: X -32.727, Y 232.147, Z -42.031, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 64 63 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 10000.00 10000.00 0.00 -0.02459 15800.00 10000.00 0.00 -0.02445 16000.00 10000.00 0.00 -0.02422 16200.00 10000.00 0.00 -0.02389 16400.00 10000.00 0.00 -0.02354 16600.00 10000.00 0.00 -0.02319 16800.00 10000.00 0.00 -0.02278 17000.00 10000.00 0.00 -0.02235 17200.00 10000.00 0.00 -0.02189 17400.00 10000.00 0.00 -0.02145 17600.00 10000.00 0.00 -0.02093 17800.00 10000.00 0.00 -0.02037 18000.00 10000.00 0.00 -0.01973 18200.00 10000.00 0.00 -0.01909 18400.00 10000.00 0.00 -0.01850 18600.00 10000.00 0.00 -0.01780 18800.00 10000.00 0.00 -0.01707 19000.00 10000.00 0.00 -0.01629 19200.00 10000.00 0.00 -0.01549 19400.00 10000.00 0.00 -0.01474 19600.00 10000.00 0.00 -0.01420 19800.00 10000.00 0.00 -0.01374 20000.00 10000.00 0.00 -0.01307 20200.00 10000.00 0.00 -0.01233 20400.00 10000.00 0.00 -0.01160 20600.00 10000.00 0.00 -0.01085 20800.00 10000.00 0.00 -0.00999 21000.00 10000.00 0.00 -0.00910 21200.00 10000.00 0.00 -0.00831 21400.00 10000.00 0.00 -0.00750 21600.00 10000.00 0.00 -0.00660 21800.00 10000.00 0.00 -0.00574 22000.00 10000.00 0.00 -0.00504 22200.00 10000.00 0.00 -0.00442 22400.00 10000.00 0.00 -0.00374 22600.00 10000.00 0.00 -0.00309 22800.00 10000.00 0.00 -0.00241 23000.00 10000.00 0.00 -0.00157 23200.00 10000.00 0.00 -0.00063 23400.00 10000.00 0.00 0.00036 23600.00 10000.00 0.00 0.00134 23800.00 10000.00 0.00 0.00243 24000.00 10000.00 0.00 0.00368 24200.00 10000.00 0.00 0.00491 24400.00 10000.00 0.00 0.00610 24600.00 10000.00 0.00 0.00732 24800.00 10000.00 0.00 0.00856 25000.00 10000.00 0.00 0.00988 25200.00 10000.00 0.00 0.01124 25400.00 10000.00 0.00 0.01264 25600.00 10000.00 0.00 0.01411 25800.00 10000.00 0.00 0.01574 26000.00 10000.00 0.00 0.01749 26200.00 10000.00 0.00 0.01907 26400.00 10000.00 0.00 0.02008 26600.00 10000.00 0.00 0.02063 26800.00 10000.00 0.00 0.02093 27000.00 10000.00 0.00 0.02099 26800.00 10200.00 0.00 0.02125 27000.00 10200.00 0.00 0.02129 26800.00 10400.00 0.00 0.02147 27000.00 10400.00 0.00 0.02148 26800.00 10600.00 0.00 0.02167 26600.00 10800.00 0.00 0.02174 26800.00 10800.00 0.00 0.02190 27000.00 10800.00 0.00 0.02192 26600.00 11000.00 0.00 0.02205 26800.00 11000.00 0.00 0.02221 27000.00 11000.00 0.00 0.02227 26600.00 11200.00 0.00 0.02233 26800.00 11200.00 0.00 0.02252 27000.00 11200.00 0.00 0.02261 26600.00 11400.00 0.00 0.02269 26800.00 11400.00 0.00 0.02292 27000.00 11400.00 0.00 0.02302 26600.00 11600.00 0.00 0.02310 26800.00 11600.00 0.00 0.02333 27000.00 11600.00 0.00 0.02343 26600.00 11800.00 0.00 0.02348 26800.00 11800.00 0.00 0.02370 27000.00 11800.00 0.00 0.02375 26600.00 12000.00 0.00 0.02391 26800.00 12000.00 0.00 0.02408 26600.00 12200.00 0.00 0.02431 26800.00 12200.00 0.00 0.02446 26600.00 12400.00 0.00 0.02469 26800.00 12400.00 0.00 0.02483 26600.00 12600.00 0.00 0.02514 26800.00 12600.00 0.00 0.02528 26600.00 12800.00 0.00 0.02568 26800.00 12800.00 0.00 0.02579 26600.00 13000.00 0.00 0.02617 26800.00 13000.00 0.00 0.02624 26400.00 13200.00 0.00 0.02632 26600.00 13200.00 0.00 0.02666 26800.00 13200.00 0.00 0.02672 26400.00 13400.00 0.00 0.02687 26600.00 13400.00 0.00 0.02719 26800.00 13400.00 0.00 0.02728 27000.00 13400.00 0.00 0.02728 26400.00 13600.00 0.00 0.02743 26600.00 13600.00 0.00 0.02778 26800.00 13600.00 0.00 0.02792 27000.00 13600.00 0.00 0.02795 26400.00 13800.00 0.00 0.02804 26600.00 13800.00 0.00 0.02841 26800.00 13800.00 0.00 0.02856 27000.00 13800.00 0.00 0.02857 26400.00 14000.00 0.00 0.02867 26600.00 14000.00 0.00 0.02903 26800.00 14000.00 0.00 0.02915 27000.00 14000.00 0.00 0.02915 26400.00 14200.00 0.00 0.02937 26600.00 14200.00 0.00 0.02971 26800.00 14200.00 0.00 0.02983 27000.00 14200.00 0.00 0.02985 26400.00 14400.00 0.00 0.03006 26600.00 14400.00 0.00 0.03040 26800.00 14400.00 0.00 0.03053 27000.00 14400.00 0.00 0.03054 26400.00 14600.00 0.00 0.03070 26600.00 14600.00 0.00 0.03106 26800.00 14600.00 0.00 0.03118 26400.00 14800.00 0.00 0.03136 26600.00 14800.00 0.00 0.03174 26800.00 14800.00 0.00 0.03183 26400.00 15000.00 0.00 0.03207 26600.00 15000.00 0.00 0.03241 26800.00 15000.00 0.00 0.03244 26400.00 15200.00 0.00 0.03274 26600.00 15200.00 0.00 0.03302 26400.00 15400.00 0.00 0.03343 26600.00 15400.00 0.00 0.03367 26400.00 15600.00 0.00 0.03423 26600.00 15600.00 0.00 0.03444 26400.00 15800.00 0.00 0.03493 26600.00 15800.00 0.00 0.03512 26400.00 16000.00 0.00 0.03556 26600.00 16000.00 0.00 0.03572 26400.00 16200.00 0.00 0.03627 26600.00 16200.00 0.00 0.03640 26400.00 16400.00 0.00 0.03698 26600.00 16400.00 0.00 0.03709 26400.00 16600.00 0.00 0.03763 26600.00 16600.00 0.00 0.03779 26800.00 16600.00 0.00 0.03784 26400.00 16800.00 0.00 0.03846 26600.00 16800.00 0.00 0.03867 26800.00 16800.00 0.00 0.03874 26400.00 17000.00 0.00 0.03936 26600.00 17000.00 0.00 0.03956 26800.00 17000.00 0.00 0.03962 26400.00 17200.00 0.00 0.04014 26600.00 17200.00 0.00 0.04035 26800.00 17200.00 0.00 0.04039 26400.00 17400.00 0.00 0.04105 26600.00 17400.00 0.00 0.04129 26800.00 17400.00 0.00 0.04131 26400.00 17600.00 0.00 0.04205 26600.00 17600.00 0.00 0.04229 26400.00 17800.00 0.00 0.04310 26600.00 17800.00 0.00 0.04331 26400.00 18000.00 0.00 0.04410 26600.00 18000.00 0.00 0.04432 26400.00 18200.00 0.00 0.04505 26600.00 18200.00 0.00 0.04532 26400.00 18400.00 0.00 0.04610 26600.00 18400.00 0.00 0.04639 26400.00 18600.00 0.00 0.04719 26600.00 18600.00 0.00 0.04744 26400.00 18800.00 0.00 0.04827 26600.00 18800.00 0.00 0.04843 26400.00 19000.00 0.00 0.04935 26600.00 19000.00 0.00 0.04943 26200.00 19200.00 0.00 0.04963 26400.00 19200.00 0.00 0.05056 26600.00 19200.00 0.00 0.05060 26200.00 19400.00 0.00 0.05072 26400.00 19400.00 0.00 0.05160 26200.00 19600.00 0.00 0.05163 26400.00 19600.00 0.00 0.05249 26200.00 19800.00 0.00 0.05267 26400.00 19800.00 0.00 0.05355 26200.00 20000.00 0.00 0.05371 26400.00 20000.00 0.00 0.05459 26200.00 20200.00 0.00 0.05477 26400.00 20200.00 0.00 0.05565 26200.00 20400.00 0.00 0.05591 26400.00 20400.00 0.00 0.05678 26200.00 20600.00 0.00 0.05704 26400.00 20600.00 0.00 0.05787 26200.00 20800.00 0.00 0.05824 26400.00 20800.00 0.00 0.05904 26200.00 21000.00 0.00 0.05945 26400.00 21000.00 0.00 0.06024 26200.00 21200.00 0.00 0.06066 26400.00 21200.00 0.00 0.06146 26200.00 21400.00 0.00 0.06198 26400.00 21400.00 0.00 0.06275 26200.00 21600.00 0.00 0.06326 26400.00 21600.00 0.00 0.06399 26200.00 21800.00 0.00 0.06468 26400.00 21800.00 0.00 0.06539 26200.00 22000.00 0.00 0.06630 26400.00 22000.00 0.00 0.06700 26200.00 22200.00 0.00 0.06797 26400.00 22200.00 0.00 0.06863 26200.00 22400.00 0.00 0.06961 26400.00 22400.00 0.00 0.07027 26200.00 22600.00 0.00 0.07130 26400.00 22600.00 0.00 0.07198 26200.00 22800.00 0.00 0.07318 26400.00 22800.00 0.00 0.07386 26200.00 23000.00 0.00 0.07489 26400.00 23000.00 0.00 0.07552 26200.00 23200.00 0.00 0.07655 26400.00 23200.00 0.00 0.07716 26200.00 23400.00 0.00 0.07830 26400.00 23400.00 0.00 0.07893 26200.00 23600.00 0.00 0.08021 26400.00 23600.00 0.00 0.08086 26200.00 23800.00 0.00 0.08246 26400.00 23800.00 0.00 0.08310 26200.00 24000.00 0.00 0.08475 26400.00 24000.00 0.00 0.08532 26200.00 24200.00 0.00 0.08719 26400.00 24200.00 0.00 0.08765 26200.00 24400.00 0.00 0.08960 26400.00 24400.00 0.00 0.08993 26200.00 24600.00 0.00 0.09215 26400.00 24600.00 0.00 0.09234 26000.00 24800.00 0.00 0.09256 26200.00 24800.00 0.00 0.09478 26400.00 24800.00 0.00 0.09478 26000.00 25000.00 0.00 0.09516 26200.00 25000.00 0.00 0.09728 26000.00 25200.00 0.00 0.09807 26200.00 25200.00 0.00 0.10009 26000.00 25400.00 0.00 0.10114 26200.00 25400.00 0.00 0.10300 26000.00 25600.00 0.00 0.10437 26200.00 25600.00 0.00 0.10601 26000.00 25800.00 0.00 0.10749 26200.00 25800.00 0.00 0.10879 26000.00 26000.00 0.00 0.11024 26200.00 26000.00 0.00 0.11084 26000.00 26200.00 5.00 0.11086 26000.00 26200.00 10.00 0.11105 26000.00 26200.00 15.00 0.11123 26000.00 26200.00 20.00 0.11140 26000.00 26200.00 25.00 0.11155 26000.00 26200.00 30.00 0.11167 26000.00 26200.00 35.00 0.11176 26000.00 26200.00 40.00 0.11183 26000.00 26200.00 45.00 0.11186 26000.00 26200.00 50.00 0.11187 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 26000.00 26193.32 47.98 0.11187 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs_0601/565.ctf NX, NY, NZ: 512 512 1 MODE : real