CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs_0601/563.mrc Output diagnostic file name Micrographs_0601/563.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 512 35.0 3.0 10000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs_0601/563.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2408.000 8366.000 Mean, RMS : 4501.033 230.9606 TITLE 1: emi2mrc: 563.emi Mon Jan 06 18:55:57 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 21990, Spot 4, Int 55.04%, Obj 88.06%, Dif 73.67% TITLE 3: X -31.161, Y 234.178, Z -42.031, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 64 63 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 10000.00 10000.00 0.00 -0.02976 15000.00 10000.00 0.00 -0.02965 15200.00 10000.00 0.00 -0.02944 15400.00 10000.00 0.00 -0.02922 15600.00 10000.00 0.00 -0.02903 15800.00 10000.00 0.00 -0.02879 16000.00 10000.00 0.00 -0.02840 16200.00 10000.00 0.00 -0.02793 16400.00 10000.00 0.00 -0.02756 16600.00 10000.00 0.00 -0.02725 16800.00 10000.00 0.00 -0.02681 17000.00 10000.00 0.00 -0.02639 17200.00 10000.00 0.00 -0.02598 17400.00 10000.00 0.00 -0.02546 17600.00 10000.00 0.00 -0.02484 17800.00 10000.00 0.00 -0.02429 18000.00 10000.00 0.00 -0.02367 18200.00 10000.00 0.00 -0.02292 18400.00 10000.00 0.00 -0.02222 18600.00 10000.00 0.00 -0.02150 18800.00 10000.00 0.00 -0.02075 19000.00 10000.00 0.00 -0.02011 19200.00 10000.00 0.00 -0.01957 19400.00 10000.00 0.00 -0.01900 19600.00 10000.00 0.00 -0.01823 19800.00 10000.00 0.00 -0.01729 20000.00 10000.00 0.00 -0.01628 20200.00 10000.00 0.00 -0.01535 20400.00 10000.00 0.00 -0.01454 20600.00 10000.00 0.00 -0.01380 20800.00 10000.00 0.00 -0.01306 21000.00 10000.00 0.00 -0.01217 21200.00 10000.00 0.00 -0.01126 21400.00 10000.00 0.00 -0.01054 21600.00 10000.00 0.00 -0.00971 21800.00 10000.00 0.00 -0.00872 22000.00 10000.00 0.00 -0.00777 22200.00 10000.00 0.00 -0.00690 22400.00 10000.00 0.00 -0.00600 22600.00 10000.00 0.00 -0.00490 22800.00 10000.00 0.00 -0.00381 23000.00 10000.00 0.00 -0.00271 23200.00 10000.00 0.00 -0.00148 23400.00 10000.00 0.00 -0.00024 23600.00 10000.00 0.00 0.00096 23800.00 10000.00 0.00 0.00206 24000.00 10000.00 0.00 0.00321 24200.00 10000.00 0.00 0.00437 24400.00 10000.00 0.00 0.00555 24600.00 10000.00 0.00 0.00683 24800.00 10000.00 0.00 0.00824 25000.00 10000.00 0.00 0.00985 25200.00 10000.00 0.00 0.01146 25400.00 10000.00 0.00 0.01302 25600.00 10000.00 0.00 0.01442 25800.00 10000.00 0.00 0.01544 26000.00 10000.00 0.00 0.01613 26200.00 10000.00 0.00 0.01655 26400.00 10000.00 0.00 0.01688 26600.00 10000.00 0.00 0.01712 26800.00 10000.00 0.00 0.01718 27000.00 10000.00 0.00 0.01720 26400.00 10200.00 0.00 0.01725 26600.00 10200.00 0.00 0.01746 26800.00 10200.00 0.00 0.01750 26400.00 10400.00 0.00 0.01752 26600.00 10400.00 0.00 0.01767 26800.00 10400.00 0.00 0.01769 26400.00 10600.00 0.00 0.01770 26600.00 10600.00 0.00 0.01785 26800.00 10600.00 0.00 0.01788 26400.00 10800.00 0.00 0.01795 26600.00 10800.00 0.00 0.01811 26800.00 10800.00 0.00 0.01815 26400.00 11000.00 0.00 0.01836 26600.00 11000.00 0.00 0.01851 26800.00 11000.00 0.00 0.01853 26400.00 11200.00 0.00 0.01870 26600.00 11200.00 0.00 0.01883 26800.00 11200.00 0.00 0.01884 26400.00 11400.00 0.00 0.01904 26600.00 11400.00 0.00 0.01917 26800.00 11400.00 0.00 0.01918 26400.00 11600.00 0.00 0.01938 26600.00 11600.00 0.00 0.01949 26200.00 11800.00 0.00 0.01951 26400.00 11800.00 0.00 0.01974 26600.00 11800.00 0.00 0.01983 26200.00 12000.00 0.00 0.02002 26400.00 12000.00 0.00 0.02023 26600.00 12000.00 0.00 0.02032 26200.00 12200.00 0.00 0.02055 26400.00 12200.00 0.00 0.02076 26600.00 12200.00 0.00 0.02085 26200.00 12400.00 0.00 0.02109 26400.00 12400.00 0.00 0.02128 26600.00 12400.00 0.00 0.02135 26200.00 12600.00 0.00 0.02161 26400.00 12600.00 0.00 0.02178 26600.00 12600.00 0.00 0.02183 26200.00 12800.00 0.00 0.02215 26400.00 12800.00 0.00 0.02232 26600.00 12800.00 0.00 0.02238 26000.00 13000.00 0.00 0.02240 26200.00 13000.00 0.00 0.02274 26400.00 13000.00 0.00 0.02291 26600.00 13000.00 0.00 0.02297 26000.00 13200.00 0.00 0.02298 26200.00 13200.00 0.00 0.02331 26400.00 13200.00 0.00 0.02348 26600.00 13200.00 0.00 0.02353 26000.00 13400.00 0.00 0.02361 26200.00 13400.00 0.00 0.02393 26400.00 13400.00 0.00 0.02411 26600.00 13400.00 0.00 0.02415 26000.00 13600.00 0.00 0.02425 26200.00 13600.00 0.00 0.02456 26400.00 13600.00 0.00 0.02471 26000.00 13800.00 0.00 0.02472 26200.00 13800.00 0.00 0.02501 26400.00 13800.00 0.00 0.02512 26000.00 14000.00 0.00 0.02517 26200.00 14000.00 0.00 0.02543 26400.00 14000.00 0.00 0.02550 26000.00 14200.00 0.00 0.02568 26200.00 14200.00 0.00 0.02592 26400.00 14200.00 0.00 0.02600 26000.00 14400.00 0.00 0.02623 26200.00 14400.00 0.00 0.02649 26400.00 14400.00 0.00 0.02661 26600.00 14400.00 0.00 0.02665 26000.00 14600.00 0.00 0.02692 26200.00 14600.00 0.00 0.02721 26400.00 14600.00 0.00 0.02737 26600.00 14600.00 0.00 0.02740 26000.00 14800.00 0.00 0.02762 26200.00 14800.00 0.00 0.02792 26400.00 14800.00 0.00 0.02805 26000.00 15000.00 0.00 0.02821 26200.00 15000.00 0.00 0.02849 26400.00 15000.00 0.00 0.02858 26000.00 15200.00 0.00 0.02883 26200.00 15200.00 0.00 0.02909 26400.00 15200.00 0.00 0.02917 26000.00 15400.00 0.00 0.02955 26200.00 15400.00 0.00 0.02979 26400.00 15400.00 0.00 0.02985 26000.00 15600.00 0.00 0.03029 26200.00 15600.00 0.00 0.03054 26400.00 15600.00 0.00 0.03063 26000.00 15800.00 0.00 0.03114 26200.00 15800.00 0.00 0.03144 26400.00 15800.00 0.00 0.03155 26000.00 16000.00 0.00 0.03212 26200.00 16000.00 0.00 0.03244 26400.00 16000.00 0.00 0.03251 26000.00 16200.00 0.00 0.03310 26200.00 16200.00 0.00 0.03338 25800.00 16400.00 0.00 0.03356 26000.00 16400.00 0.00 0.03422 26200.00 16400.00 0.00 0.03442 25800.00 16600.00 0.00 0.03461 26000.00 16600.00 0.00 0.03519 26200.00 16600.00 0.00 0.03528 25800.00 16800.00 0.00 0.03538 26000.00 16800.00 0.00 0.03591 26200.00 16800.00 0.00 0.03595 25800.00 17000.00 0.00 0.03627 26000.00 17000.00 0.00 0.03677 26200.00 17000.00 0.00 0.03680 25800.00 17200.00 0.00 0.03722 26000.00 17200.00 0.00 0.03768 26200.00 17200.00 0.00 0.03768 25800.00 17400.00 0.00 0.03809 26000.00 17400.00 0.00 0.03853 26200.00 17400.00 0.00 0.03856 25800.00 17600.00 0.00 0.03908 26000.00 17600.00 0.00 0.03955 26200.00 17600.00 0.00 0.03962 25800.00 17800.00 0.00 0.04029 26000.00 17800.00 0.00 0.04077 26200.00 17800.00 0.00 0.04087 26400.00 17800.00 0.00 0.04090 25800.00 18000.00 0.00 0.04144 26000.00 18000.00 0.00 0.04196 26200.00 18000.00 0.00 0.04208 26400.00 18000.00 0.00 0.04212 25800.00 18200.00 0.00 0.04262 26000.00 18200.00 0.00 0.04316 26200.00 18200.00 0.00 0.04329 26400.00 18200.00 0.00 0.04332 25800.00 18400.00 0.00 0.04391 26000.00 18400.00 0.00 0.04443 26200.00 18400.00 0.00 0.04455 25800.00 18600.00 0.00 0.04520 26000.00 18600.00 0.00 0.04570 26200.00 18600.00 0.00 0.04581 25800.00 18800.00 0.00 0.04653 26000.00 18800.00 0.00 0.04701 26200.00 18800.00 0.00 0.04710 25800.00 19000.00 0.00 0.04783 26000.00 19000.00 0.00 0.04827 26200.00 19000.00 0.00 0.04834 25800.00 19200.00 0.00 0.04906 26000.00 19200.00 0.00 0.04950 26200.00 19200.00 0.00 0.04955 25800.00 19400.00 0.00 0.05025 26000.00 19400.00 0.00 0.05069 26200.00 19400.00 0.00 0.05073 25800.00 19600.00 0.00 0.05153 26000.00 19600.00 0.00 0.05194 25800.00 19800.00 0.00 0.05283 26000.00 19800.00 0.00 0.05318 25800.00 20000.00 0.00 0.05416 26000.00 20000.00 0.00 0.05448 25800.00 20200.00 0.00 0.05547 26000.00 20200.00 0.00 0.05574 25800.00 20400.00 0.00 0.05671 26000.00 20400.00 0.00 0.05694 25600.00 20600.00 0.00 0.05700 25800.00 20600.00 0.00 0.05808 26000.00 20600.00 0.00 0.05833 26200.00 20600.00 0.00 0.05834 25600.00 20800.00 0.00 0.05837 25800.00 20800.00 0.00 0.05947 26000.00 20800.00 0.00 0.05976 26200.00 20800.00 0.00 0.05979 25800.00 21000.00 0.00 0.06087 26000.00 21000.00 0.00 0.06117 26200.00 21000.00 0.00 0.06117 25800.00 21200.00 0.00 0.06222 26000.00 21200.00 0.00 0.06252 25800.00 21400.00 0.00 0.06351 26000.00 21400.00 0.00 0.06384 25800.00 21600.00 0.00 0.06489 26000.00 21600.00 0.00 0.06522 25600.00 21800.00 0.00 0.06529 25800.00 21800.00 0.00 0.06639 26000.00 21800.00 0.00 0.06669 25600.00 22000.00 0.00 0.06686 25800.00 22000.00 0.00 0.06798 26000.00 22000.00 0.00 0.06827 25600.00 22200.00 0.00 0.06849 25800.00 22200.00 0.00 0.06966 26000.00 22200.00 0.00 0.06992 25600.00 22400.00 0.00 0.07023 25800.00 22400.00 0.00 0.07142 26000.00 22400.00 0.00 0.07160 25600.00 22600.00 0.00 0.07194 25800.00 22600.00 0.00 0.07310 26000.00 22600.00 0.00 0.07316 25600.00 22800.00 0.00 0.07381 25800.00 22800.00 0.00 0.07491 25600.00 23000.00 0.00 0.07566 25800.00 23000.00 0.00 0.07671 25600.00 23200.00 0.00 0.07741 25800.00 23200.00 0.00 0.07846 25600.00 23400.00 0.00 0.07923 25800.00 23400.00 0.00 0.08030 25600.00 23600.00 0.00 0.08104 25800.00 23600.00 0.00 0.08209 25600.00 23800.00 0.00 0.08300 25800.00 23800.00 0.00 0.08402 25600.00 24000.00 0.00 0.08499 25800.00 24000.00 0.00 0.08597 25600.00 24200.00 0.00 0.08716 25800.00 24200.00 0.00 0.08806 25600.00 24400.00 0.00 0.08942 25800.00 24400.00 0.00 0.09020 25600.00 24600.00 0.00 0.09165 25800.00 24600.00 0.00 0.09228 25600.00 24800.00 0.00 0.09398 25800.00 24800.00 0.00 0.09440 25400.00 25000.00 0.00 0.09476 25600.00 25000.00 0.00 0.09637 25800.00 25000.00 0.00 0.09649 25400.00 25200.00 0.00 0.09716 25600.00 25200.00 0.00 0.09851 25400.00 25400.00 0.00 0.09882 25600.00 25400.00 0.00 0.09993 25600.00 25600.00 0.00 0.10048 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 25638.59 25512.23 -38.30 0.10062 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs_0601/563.ctf NX, NY, NZ: 512 512 1 MODE : real