CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs_0601/235.mrc Output diagnostic file name Micrographs_0601/235.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 512 35.0 3.0 10000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs_0601/235.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2258.000 8074.000 Mean, RMS : 4498.056 221.1537 TITLE 1: emi2mrc: 235.emi Sun Jan 05 19:51:17 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 27730, Spot 4, Int 55.08%, Obj 88.06%, Dif 73.67% TITLE 3: X 31.418, Y 521.651, Z -81.545, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 64 63 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 10000.00 10000.00 0.00 -0.00358 11400.00 10000.00 0.00 -0.00322 11600.00 10000.00 0.00 -0.00278 11800.00 10000.00 0.00 -0.00244 12000.00 10000.00 0.00 -0.00206 12200.00 10000.00 0.00 -0.00151 12400.00 10000.00 0.00 -0.00091 12600.00 10000.00 0.00 -0.00041 12800.00 10000.00 0.00 -0.00003 13000.00 10000.00 0.00 0.00038 13200.00 10000.00 0.00 0.00090 13400.00 10000.00 0.00 0.00143 13600.00 10000.00 0.00 0.00196 13800.00 10000.00 0.00 0.00266 14000.00 10000.00 0.00 0.00336 14200.00 10000.00 0.00 0.00401 14400.00 10000.00 0.00 0.00474 14600.00 10000.00 0.00 0.00545 14800.00 10000.00 0.00 0.00613 15000.00 10000.00 0.00 0.00681 15200.00 10000.00 0.00 0.00756 15400.00 10000.00 0.00 0.00838 15600.00 10000.00 0.00 0.00913 15800.00 10000.00 0.00 0.01006 16000.00 10000.00 0.00 0.01108 16200.00 10000.00 0.00 0.01201 16400.00 10000.00 0.00 0.01307 16600.00 10000.00 0.00 0.01419 16800.00 10000.00 0.00 0.01526 17000.00 10000.00 0.00 0.01643 17200.00 10000.00 0.00 0.01755 17400.00 10000.00 0.00 0.01862 17600.00 10000.00 0.00 0.01974 17800.00 10000.00 0.00 0.02103 18000.00 10000.00 0.00 0.02229 18200.00 10000.00 0.00 0.02347 18400.00 10000.00 0.00 0.02487 18600.00 10000.00 0.00 0.02638 18800.00 10000.00 0.00 0.02805 19000.00 10000.00 0.00 0.02980 19200.00 10000.00 0.00 0.03157 19400.00 10000.00 0.00 0.03346 19600.00 10000.00 0.00 0.03543 19800.00 10000.00 0.00 0.03746 20000.00 10000.00 0.00 0.03944 20200.00 10000.00 0.00 0.04170 20400.00 10000.00 0.00 0.04411 20600.00 10000.00 0.00 0.04657 20800.00 10000.00 0.00 0.04897 21000.00 10000.00 0.00 0.05047 21200.00 10000.00 0.00 0.05117 21400.00 10000.00 0.00 0.05145 21600.00 10000.00 0.00 0.05150 21800.00 10000.00 0.00 0.05153 22000.00 10000.00 0.00 0.05154 21200.00 10200.00 0.00 0.05187 21400.00 10200.00 0.00 0.05212 21600.00 10200.00 0.00 0.05214 21800.00 10200.00 0.00 0.05219 22000.00 10200.00 0.00 0.05219 21200.00 10400.00 0.00 0.05256 21400.00 10400.00 0.00 0.05277 21600.00 10400.00 0.00 0.05278 21800.00 10400.00 0.00 0.05284 21200.00 10600.00 0.00 0.05321 21400.00 10600.00 0.00 0.05340 21600.00 10600.00 0.00 0.05342 21800.00 10600.00 0.00 0.05349 21200.00 10800.00 0.00 0.05391 21400.00 10800.00 0.00 0.05410 21600.00 10800.00 0.00 0.05412 21800.00 10800.00 0.00 0.05420 21200.00 11000.00 0.00 0.05471 21400.00 11000.00 0.00 0.05488 21600.00 11000.00 0.00 0.05491 21800.00 11000.00 0.00 0.05501 21200.00 11200.00 0.00 0.05544 21400.00 11200.00 0.00 0.05561 21600.00 11200.00 0.00 0.05566 21800.00 11200.00 0.00 0.05579 21200.00 11400.00 0.00 0.05629 21400.00 11400.00 0.00 0.05647 21600.00 11400.00 0.00 0.05656 21800.00 11400.00 0.00 0.05671 21200.00 11600.00 0.00 0.05714 21400.00 11600.00 0.00 0.05736 21600.00 11600.00 0.00 0.05751 21800.00 11600.00 0.00 0.05766 21200.00 11800.00 0.00 0.05804 21400.00 11800.00 0.00 0.05829 21600.00 11800.00 0.00 0.05845 21800.00 11800.00 0.00 0.05855 21200.00 12000.00 0.00 0.05902 21400.00 12000.00 0.00 0.05927 21600.00 12000.00 0.00 0.05938 21800.00 12000.00 0.00 0.05943 21000.00 12200.00 0.00 0.05943 21200.00 12200.00 0.00 0.06007 21400.00 12200.00 0.00 0.06032 21600.00 12200.00 0.00 0.06042 21800.00 12200.00 0.00 0.06047 21000.00 12400.00 0.00 0.06051 21200.00 12400.00 0.00 0.06118 21400.00 12400.00 0.00 0.06146 21600.00 12400.00 0.00 0.06156 21800.00 12400.00 0.00 0.06160 21200.00 12600.00 0.00 0.06228 21400.00 12600.00 0.00 0.06255 21600.00 12600.00 0.00 0.06262 21000.00 12800.00 0.00 0.06278 21200.00 12800.00 0.00 0.06347 21400.00 12800.00 0.00 0.06370 21000.00 13000.00 0.00 0.06388 21200.00 13000.00 0.00 0.06453 21400.00 13000.00 0.00 0.06468 21000.00 13200.00 0.00 0.06511 21200.00 13200.00 0.00 0.06571 21400.00 13200.00 0.00 0.06580 21000.00 13400.00 0.00 0.06641 21200.00 13400.00 0.00 0.06696 21400.00 13400.00 0.00 0.06705 21000.00 13600.00 0.00 0.06768 21200.00 13600.00 0.00 0.06825 21400.00 13600.00 0.00 0.06838 21600.00 13600.00 0.00 0.06838 21800.00 13600.00 0.00 0.06840 21000.00 13800.00 0.00 0.06911 21200.00 13800.00 0.00 0.06973 21400.00 13800.00 0.00 0.06989 21600.00 13800.00 0.00 0.06990 21000.00 14000.00 0.00 0.07054 21200.00 14000.00 0.00 0.07119 21400.00 14000.00 0.00 0.07132 21000.00 14200.00 0.00 0.07192 21200.00 14200.00 0.00 0.07256 21400.00 14200.00 0.00 0.07267 21000.00 14400.00 0.00 0.07319 21200.00 14400.00 0.00 0.07385 21400.00 14400.00 0.00 0.07397 21000.00 14600.00 0.00 0.07471 21200.00 14600.00 0.00 0.07537 21400.00 14600.00 0.00 0.07547 21000.00 14800.00 0.00 0.07629 21200.00 14800.00 0.00 0.07694 21400.00 14800.00 0.00 0.07700 21000.00 15000.00 0.00 0.07781 21200.00 15000.00 0.00 0.07846 21400.00 15000.00 0.00 0.07848 21000.00 15200.00 0.00 0.07929 21200.00 15200.00 0.00 0.07992 21000.00 15400.00 0.00 0.08077 21200.00 15400.00 0.00 0.08136 21000.00 15600.00 0.00 0.08241 21200.00 15600.00 0.00 0.08296 21000.00 15800.00 0.00 0.08403 21200.00 15800.00 0.00 0.08452 21000.00 16000.00 0.00 0.08583 21200.00 16000.00 0.00 0.08629 21000.00 16200.00 0.00 0.08775 21200.00 16200.00 0.00 0.08817 20800.00 16400.00 0.00 0.08818 21000.00 16400.00 0.00 0.08973 21200.00 16400.00 0.00 0.09011 21000.00 16600.00 0.00 0.09159 21200.00 16600.00 0.00 0.09195 21000.00 16800.00 0.00 0.09343 21200.00 16800.00 0.00 0.09376 20800.00 17000.00 0.00 0.09383 21000.00 17000.00 0.00 0.09533 21200.00 17000.00 0.00 0.09563 20800.00 17200.00 0.00 0.09567 21000.00 17200.00 0.00 0.09717 21200.00 17200.00 0.00 0.09744 20800.00 17400.00 0.00 0.09770 21000.00 17400.00 0.00 0.09919 21200.00 17400.00 0.00 0.09939 20800.00 17600.00 0.00 0.09952 21000.00 17600.00 0.00 0.10098 21200.00 17600.00 0.00 0.10109 20800.00 17800.00 0.00 0.10135 21000.00 17800.00 0.00 0.10282 21200.00 17800.00 0.00 0.10286 20800.00 18000.00 0.00 0.10346 21000.00 18000.00 0.00 0.10494 20800.00 18200.00 0.00 0.10559 21000.00 18200.00 0.00 0.10702 20800.00 18400.00 0.00 0.10771 21000.00 18400.00 0.00 0.10909 20800.00 18600.00 0.00 0.11002 21000.00 18600.00 0.00 0.11135 20800.00 18800.00 0.00 0.11256 21000.00 18800.00 0.00 0.11383 20800.00 19000.00 0.00 0.11517 21000.00 19000.00 0.00 0.11637 20800.00 19200.00 0.00 0.11796 21000.00 19200.00 0.00 0.11899 20800.00 19400.00 0.00 0.12044 21000.00 19400.00 0.00 0.12129 20800.00 19600.00 0.00 0.12291 21000.00 19600.00 0.00 0.12361 20800.00 19800.00 0.00 0.12548 21000.00 19800.00 0.00 0.12608 20800.00 20000.00 0.00 0.12821 21000.00 20000.00 0.00 0.12863 20800.00 20200.00 0.00 0.13111 21000.00 20200.00 0.00 0.13123 20800.00 20400.00 0.00 0.13372 20600.00 20600.00 0.00 0.13400 20800.00 20600.00 0.00 0.13627 20600.00 20800.00 0.00 0.13634 20800.00 20800.00 0.00 0.13778 20800.00 21000.00 0.00 0.13780 20800.00 21000.00 5.00 0.13796 20800.00 21000.00 10.00 0.13809 20800.00 21000.00 15.00 0.13820 20800.00 21000.00 20.00 0.13827 20800.00 21000.00 25.00 0.13831 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 20726.03 20987.44 28.45 0.13859 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs_0601/235.ctf NX, NY, NZ: 512 512 1 MODE : real