CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs_0601/009.mrc Output diagnostic file name Micrographs_0601/009.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 512 35.0 3.0 10000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs_0601/009.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2588.000 8312.000 Mean, RMS : 4557.303 226.8692 TITLE 1: emi2mrc: 009.emi Sun Jan 05 12:36:27 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 28060, Spot 4, Int 55.10%, Obj 88.02%, Dif 73.67% TITLE 3: X 343.949, Y 274.548, Z -105.996, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 64 63 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 10000.00 10000.00 0.00 -0.02211 37600.00 10000.00 0.00 -0.02122 37800.00 10000.00 0.00 -0.01981 38000.00 10000.00 0.00 -0.01829 38200.00 10000.00 0.00 -0.01670 38400.00 10000.00 0.00 -0.01508 38600.00 10000.00 0.00 -0.01361 38800.00 10000.00 0.00 -0.01234 39000.00 10000.00 0.00 -0.01151 39200.00 10000.00 0.00 -0.01107 39400.00 10000.00 0.00 -0.01089 39400.00 21000.00 0.00 -0.01085 39600.00 21000.00 0.00 -0.01081 39800.00 21000.00 0.00 -0.01077 40000.00 21000.00 0.00 -0.01074 39200.00 21200.00 0.00 -0.01062 39400.00 21200.00 0.00 -0.01032 39600.00 21200.00 0.00 -0.01026 39800.00 21200.00 0.00 -0.01020 39200.00 21400.00 0.00 -0.01011 39400.00 21400.00 0.00 -0.00980 39600.00 21400.00 0.00 -0.00976 39800.00 21400.00 0.00 -0.00973 39200.00 21600.00 0.00 -0.00957 39400.00 21600.00 0.00 -0.00927 39600.00 21600.00 0.00 -0.00926 39200.00 21800.00 0.00 -0.00896 39400.00 21800.00 0.00 -0.00870 39200.00 22000.00 0.00 -0.00840 39400.00 22000.00 0.00 -0.00823 39200.00 22200.00 0.00 -0.00803 39400.00 22200.00 0.00 -0.00793 39200.00 22400.00 0.00 -0.00774 39400.00 22400.00 0.00 -0.00765 39200.00 22600.00 0.00 -0.00734 39400.00 22600.00 0.00 -0.00723 39200.00 22800.00 0.00 -0.00683 39400.00 22800.00 0.00 -0.00669 39200.00 23000.00 0.00 -0.00630 39400.00 23000.00 0.00 -0.00619 39200.00 23200.00 0.00 -0.00595 39400.00 23200.00 0.00 -0.00590 39200.00 23400.00 0.00 -0.00579 39400.00 23400.00 0.00 -0.00577 39200.00 23600.00 0.00 -0.00558 39400.00 23600.00 0.00 -0.00558 39200.00 23800.00 0.00 -0.00530 39200.00 24000.00 0.00 -0.00506 39200.00 24200.00 0.00 -0.00483 39200.00 24400.00 0.00 -0.00453 39400.00 24400.00 0.00 -0.00449 39800.00 24400.00 0.00 -0.00448 39200.00 24600.00 0.00 -0.00410 39400.00 24600.00 0.00 -0.00403 39200.00 24800.00 0.00 -0.00360 39400.00 24800.00 0.00 -0.00354 39200.00 25000.00 0.00 -0.00315 39400.00 25000.00 0.00 -0.00311 39200.00 25200.00 0.00 -0.00271 39400.00 25200.00 0.00 -0.00268 39000.00 25400.00 0.00 -0.00262 39200.00 25400.00 0.00 -0.00221 39400.00 25400.00 0.00 -0.00218 39000.00 25600.00 0.00 -0.00207 39200.00 25600.00 0.00 -0.00168 39400.00 25600.00 0.00 -0.00163 39800.00 25600.00 0.00 -0.00160 40000.00 25600.00 0.00 -0.00158 39000.00 25800.00 0.00 -0.00154 39200.00 25800.00 0.00 -0.00111 39400.00 25800.00 0.00 -0.00098 39600.00 25800.00 0.00 -0.00088 39800.00 25800.00 0.00 -0.00075 40000.00 25800.00 0.00 -0.00068 39200.00 26000.00 0.00 -0.00041 39400.00 26000.00 0.00 -0.00020 39600.00 26000.00 0.00 -0.00006 39800.00 26000.00 0.00 0.00008 40000.00 26000.00 0.00 0.00010 39200.00 26200.00 0.00 0.00024 39400.00 26200.00 0.00 0.00049 39600.00 26200.00 0.00 0.00063 39800.00 26200.00 0.00 0.00073 39200.00 26400.00 0.00 0.00089 39400.00 26400.00 0.00 0.00114 39600.00 26400.00 0.00 0.00125 39800.00 26400.00 0.00 0.00132 39200.00 26600.00 0.00 0.00171 39400.00 26600.00 0.00 0.00191 39600.00 26600.00 0.00 0.00198 39800.00 26600.00 0.00 0.00203 39200.00 26800.00 0.00 0.00246 39400.00 26800.00 0.00 0.00260 39600.00 26800.00 0.00 0.00268 39800.00 26800.00 0.00 0.00276 39200.00 27000.00 0.00 0.00312 39400.00 27000.00 0.00 0.00326 39600.00 27000.00 0.00 0.00339 39800.00 27000.00 0.00 0.00347 39200.00 27200.00 0.00 0.00375 39400.00 27200.00 0.00 0.00392 39600.00 27200.00 0.00 0.00406 39800.00 27200.00 0.00 0.00407 39200.00 27400.00 0.00 0.00435 39400.00 27400.00 0.00 0.00453 39600.00 27400.00 0.00 0.00462 39200.00 27600.00 0.00 0.00490 39400.00 27600.00 0.00 0.00506 39600.00 27600.00 0.00 0.00510 39200.00 27800.00 0.00 0.00551 39400.00 27800.00 0.00 0.00566 39600.00 27800.00 0.00 0.00571 39000.00 28000.00 0.00 0.00573 39200.00 28000.00 0.00 0.00629 39400.00 28000.00 0.00 0.00644 39600.00 28000.00 0.00 0.00651 39000.00 28200.00 0.00 0.00654 39200.00 28200.00 0.00 0.00707 39400.00 28200.00 0.00 0.00720 39600.00 28200.00 0.00 0.00727 39000.00 28400.00 0.00 0.00733 39200.00 28400.00 0.00 0.00782 39400.00 28400.00 0.00 0.00794 39600.00 28400.00 0.00 0.00803 39200.00 28600.00 0.00 0.00846 39400.00 28600.00 0.00 0.00863 39600.00 28600.00 0.00 0.00875 39200.00 28800.00 0.00 0.00908 39400.00 28800.00 0.00 0.00929 39600.00 28800.00 0.00 0.00940 39200.00 29000.00 0.00 0.00981 39400.00 29000.00 0.00 0.01002 39600.00 29000.00 0.00 0.01007 39200.00 29200.00 0.00 0.01058 39400.00 29200.00 0.00 0.01079 39000.00 29400.00 0.00 0.01097 39200.00 29400.00 0.00 0.01155 39400.00 29400.00 0.00 0.01172 39000.00 29600.00 0.00 0.01197 39200.00 29600.00 0.00 0.01247 39400.00 29600.00 0.00 0.01255 39000.00 29800.00 0.00 0.01289 39200.00 29800.00 0.00 0.01330 39400.00 29800.00 0.00 0.01334 39000.00 30000.00 0.00 0.01386 39200.00 30000.00 0.00 0.01424 39400.00 30000.00 0.00 0.01431 39000.00 30200.00 0.00 0.01464 39200.00 30200.00 0.00 0.01503 39400.00 30200.00 0.00 0.01509 39000.00 30400.00 0.00 0.01532 39200.00 30400.00 0.00 0.01573 39400.00 30400.00 0.00 0.01581 39000.00 30600.00 0.00 0.01622 39200.00 30600.00 0.00 0.01670 39400.00 30600.00 0.00 0.01679 39000.00 30800.00 0.00 0.01721 39200.00 30800.00 0.00 0.01770 39400.00 30800.00 0.00 0.01773 39000.00 31000.00 0.00 0.01824 39200.00 31000.00 0.00 0.01868 39000.00 31200.00 0.00 0.01941 39200.00 31200.00 0.00 0.01983 39000.00 31400.00 0.00 0.02065 39200.00 31400.00 0.00 0.02105 39000.00 31600.00 0.00 0.02188 39200.00 31600.00 0.00 0.02224 39000.00 31800.00 0.00 0.02303 39200.00 31800.00 0.00 0.02331 38800.00 32000.00 0.00 0.02332 39000.00 32000.00 0.00 0.02415 39200.00 32000.00 0.00 0.02439 38800.00 32200.00 0.00 0.02447 39000.00 32200.00 0.00 0.02528 39200.00 32200.00 0.00 0.02549 38800.00 32400.00 0.00 0.02553 39000.00 32400.00 0.00 0.02631 39200.00 32400.00 0.00 0.02650 38800.00 32600.00 0.00 0.02665 39000.00 32600.00 0.00 0.02743 39200.00 32600.00 0.00 0.02764 38800.00 32800.00 0.00 0.02785 39000.00 32800.00 0.00 0.02867 39200.00 32800.00 0.00 0.02892 38800.00 33000.00 0.00 0.02912 39000.00 33000.00 0.00 0.02997 39200.00 33000.00 0.00 0.03018 38800.00 33200.00 0.00 0.03048 39000.00 33200.00 0.00 0.03124 39200.00 33200.00 0.00 0.03136 38800.00 33400.00 0.00 0.03165 39000.00 33400.00 0.00 0.03230 39200.00 33400.00 0.00 0.03239 38800.00 33600.00 0.00 0.03289 39000.00 33600.00 0.00 0.03352 39200.00 33600.00 0.00 0.03370 38800.00 33800.00 0.00 0.03433 39000.00 33800.00 0.00 0.03503 39200.00 33800.00 0.00 0.03525 38800.00 34000.00 0.00 0.03589 39000.00 34000.00 0.00 0.03660 39200.00 34000.00 0.00 0.03682 38800.00 34200.00 0.00 0.03747 39000.00 34200.00 0.00 0.03815 39200.00 34200.00 0.00 0.03830 38800.00 34400.00 0.00 0.03913 39000.00 34400.00 0.00 0.03977 39200.00 34400.00 0.00 0.03993 38800.00 34600.00 0.00 0.04081 39000.00 34600.00 0.00 0.04149 39200.00 34600.00 0.00 0.04166 38800.00 34800.00 0.00 0.04259 39000.00 34800.00 0.00 0.04324 39200.00 34800.00 0.00 0.04339 38800.00 35000.00 0.00 0.04416 39000.00 35000.00 0.00 0.04482 39200.00 35000.00 0.00 0.04490 38800.00 35200.00 0.00 0.04574 39000.00 35200.00 0.00 0.04639 39200.00 35200.00 0.00 0.04649 38800.00 35400.00 0.00 0.04761 39000.00 35400.00 0.00 0.04833 39200.00 35400.00 0.00 0.04838 38800.00 35600.00 0.00 0.04966 39000.00 35600.00 0.00 0.05034 39200.00 35600.00 0.00 0.05036 38800.00 35800.00 0.00 0.05174 39000.00 35800.00 0.00 0.05242 38800.00 36000.00 0.00 0.05391 39000.00 36000.00 0.00 0.05447 38600.00 36200.00 0.00 0.05449 38800.00 36200.00 0.00 0.05596 39000.00 36200.00 0.00 0.05643 38600.00 36400.00 0.00 0.05654 38800.00 36400.00 0.00 0.05799 39000.00 36400.00 0.00 0.05836 38600.00 36600.00 0.00 0.05874 38800.00 36600.00 0.00 0.06010 39000.00 36600.00 0.00 0.06038 38600.00 36800.00 0.00 0.06111 38800.00 36800.00 0.00 0.06243 39000.00 36800.00 0.00 0.06261 38600.00 37000.00 0.00 0.06357 38800.00 37000.00 0.00 0.06479 38600.00 37200.00 0.00 0.06623 38800.00 37200.00 0.00 0.06727 38600.00 37400.00 0.00 0.06889 38800.00 37400.00 0.00 0.06982 38600.00 37600.00 0.00 0.07163 38800.00 37600.00 0.00 0.07227 38600.00 37800.00 0.00 0.07408 38800.00 37800.00 0.00 0.07465 38600.00 38000.00 0.00 0.07657 38800.00 38000.00 0.00 0.07679 38400.00 38200.00 0.00 0.07681 38600.00 38200.00 0.00 0.07859 38800.00 38200.00 0.00 0.07868 38400.00 38400.00 0.00 0.07886 38600.00 38400.00 0.00 0.08053 38400.00 38600.00 0.00 0.08065 38600.00 38600.00 0.00 0.08184 38600.00 38800.00 5.00 0.08200 38600.00 38800.00 10.00 0.08217 38600.00 38800.00 15.00 0.08231 38400.00 38800.00 20.00 0.08233 38600.00 38800.00 20.00 0.08244 38400.00 38800.00 25.00 0.08256 38400.00 38800.00 30.00 0.08274 38400.00 38800.00 35.00 0.08285 38400.00 38800.00 40.00 0.08287 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 38473.46 38829.78 37.31 0.08305 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs_0601/009.ctf NX, NY, NZ: 512 512 1 MODE : real